Det viktigaste samarbetsområdet är Vasaregionen, som omfattar Vasas och Kyrolands ekonomiska regioners 9 kommuner. I samarbetet har även Jurva 
kommun deltagit, vilken från och med år 2009
ansluts till Kurikka samt delvis också Närpes, Kristinestad och Kaskö. Till samarbetsdelegationen i enlighet med regionavtalet hör beslutsfattare på ledarskapsnivå och till dess arbetssektion regionens kommundirektörer. Till behandling upptas olika regionala samarbetsfrågor. Den viktigaste frågan för närvarande är fortsättande av kommun- och servicestrukturreformen (KSSR-projektet). Samarbetsdelegationen leder beredningen av den. Under hösten 2008 inleds som fortsättning på regionplanen ett omfattande utredningsarbete, där man behandlar både möjligheterna till kommunsamarbete och kommunsammanslagning. Vasa deltar i Finlands kommunförbunds uppföljningsundersökning för KSSR-projektet (ARTTU).
I anslutning till KSSR-projektet har Vasa, Laihela och Lillkyro kommuner bildat ett samarbetsområde inom primärvården som inleds 1.1.2009. Samarbetet omfattar även företagshälsovårdens (Vasa regionala företagshälsovård) och miljö- och hälsoskyddets uppgifter.
För uppgörandet och verkställandet av regioncentrumprogrammet svarar det av regionens kommuner ägda Vasaregionens Utveckling Ab (VASEK), som inledde sin verksamhet år 2004. Det svarar också för uppgörandet av bl.a. regionstrategin och den regionala servicestrategin.
Med Österbottens förbund och regionens kommuner har i samarbete utöver de lagstadgade planerna (bl.a. landskapsöversikten, landskapsprogrammet) uppgjorts bl.a. en samhällsstrukturplan för Vasaregionen (VASU) samt en plan för utveckling av trafiksystemen i Vasaregionen (VASELI). Vasa är från Västra Finland vid sidan om Tammerfors med i Europeiska regionutvecklingsfondens (ERUF) åtgärdsprogram för utvecklande av stora stadsregioner.
Delegationen för Österbottens landskapsärenden, som består av gamla Vasa läns landskapsförbund (Södra Österbotten, Mellersta Österbotten och Österbotten) samt de större städernas representanter, behandlar för området viktiga samarbets- och intressebevakningsfrågor och framlägger förslag som gäller dessa. Vasa stad har därtill samarbetsdelegationer med vissa städer och grannkommuner.
Stadsplaneringens uppgift är att följa med områdesutvecklingen och stadspolitiken, samla och producera datamaterial som berör dessa, bereda förslag och ställningstaganden i anslutning till områdesutvecklingen samt sköta om berednings- och utvecklingsuppgifter i anslutning till det regionala samarbetet.
Staden är representerad bl.a. i Arbets- och näringsministeriets Stadspolitiska samarbetsgruppen och Stadspolitiska samarbetsgruppens storstadssektion
och Finlands kommunförbunds stadspolitiska arbetsgrupp.